Método revolucionário em Würzburg: A atividade geral descriptografa!
Método revolucionário em Würzburg: A atividade geral descriptografa!
Würzburg, Deutschland - Um novo método inovador para analisar a atividade genética em colônias bacterianas foi desenvolvido na Universidade Júlíaio Maximilians (JMU) Würzburg e no Instituto Helmholtz para pesquisa de infecção baseada em RNA (HIRI). A tecnologia inovadora, conhecida como MATQ-seq bacteriana, representa uma variante da transcriptômica de células únicas e visa entender melhor a diversidade nas populações bacterianas, especialmente no caso de patógenos. Segundo a JMU, o método oferece uma alta taxa de retenção de células de 95%, que decola de protocolos anteriores com taxa de perda de até 70%. O MATQ-seq também analisa a atividade de 300 a 600 genes por célula bacteriana.
A publicação deste trabalho de pesquisa na revista Protocolos da Nature inclui instruções passo a passo para criar transcriptoms de bactérias individuais e, portanto, representa um recurso valioso para cientistas que lidam com a análise da expressão gênica. Todo o processo para realizar o MATQ-seq leva cerca de cinco dias e é ideal para amostras menores de centenas de células, enquanto amostras maiores com centenas de milhares de células requerem protocolos diferentes, o que, no entanto, resulta em taxas de perda mais altas e menos genes registrados.
Tecnologia e acessibilidade
No decorrer desses desenvolvimentos, o Centro de RNA-Seq de célula única microbiana (Microseq) foi lançada em Würzburg. Esta plataforma tem como objetivo tornar as tecnologias e conhecimentos acessíveis a grupos de pesquisa em todo o mundo. A Microseq faz parte do centro de célula única de Würzburg, que também oferece transcriptomanalises de células eucarióticas individuais. Com essa metodologia, as equipes de pesquisa não apenas buscam metas no campo da pesquisa básica, mas também projetos de pesquisa orientados a aplicações que podem ter um impacto direto na compreensão dos mecanismos de infecção. Além disso, a comunidade Helmholtz relata que o sequenciamento de RNA de célula único (scRNA-seq) fornece informações sobre a expressão gênica e redes regulatórias de células individuais. Essa tecnologia foi otimizada de acordo com os requisitos e desafios da pesquisa de micróbios. Verificou -se que o procedimento é mais robusto e tem uma taxa de falha reduzida ao ler informações genéticas. Antes dessa melhoria, técnicas anteriores, como o seqüenciamento de RNA de massa, apenas forneceram valores médios de uma população de células, o que não pôde ser registrado diferenças entre bactérias individuais.Resultados da pesquisa e desafios
O trabalho de pesquisa, liderado por Jörg Vogel, diretor do Instituto de Biologia da Infecção Molecular e Hiri, já demonstrou sucesso na validação do novo método de Salmonella sob várias condições de crescimento. Com essa técnica, agora é possível demonstrar pequenos rahnas regulatórios específicos (srNAs) no nível das células únicas e confirmar a heterogeneidade fenotípica dentro de uma população de células.
As melhorias também permitem o exame de atividades celulares em condições normais e reações à medicação, o que é de importância crucial para o desenvolvimento de novas abordagens terapêuticas. Os desafios, em particular, os tamanhos de pequenas células em comparação aos eucariotos, foram abordados com sucesso por métodos adaptativos para lise celular e registro de transcritos bacterianos.
Esse progresso abriu um novo capítulo no seqüenciamento de RNA de célula única, que não apenas permite o acesso a dados mais precisos, mas também suporta pesquisas sobre a adaptação de bactérias ao ambiente. Os resultados completos deste estudo são publicados na revista mbio e podem dar uma contribuição significativa para a compreensão dos processos de infecção.
Para leitores interessados, mais informações sobre os desenvolvimentos nesta direção de pesquisa podem ser encontradas nos artigos científicos correspondentes e nos sites das instituições envolvidas. Os relatórios da JMU que Esta nova metodologia oferece grandes oportunidades para a compreensão da diversidade bacteriana e seus mecanismos de adaptação. O apoio de abordagens inovadoras de pesquisa é crucial para combater infecções bacterianas e o desenvolvimento de novas abordagens de terapia. Mais detalhes também estão em Protocolos da Nature e no helmholtz-gemochaft
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| Ort | Würzburg, Deutschland |
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